JP2006515065A — 蛍光配列の読み取り

USPTO Abstract

臨床設定中の蛍光配列（１０３）の読み取りは、配列の暗視野照明を用いて構成した読み取り器（１１０）と、蛍光配列寸法（Ｄｏ）と同級の大きさの撮像寸法（Ｄｉ）、好ましくは縮減された画像を用いたソリッドステートセンサ配列（１４６）上への配列画像の写像とを用いて可能となる。高輝度照明を用い、その非一様性は配列の撮像期間中に検出される配列自体の輝度較正特徴（１６４）を用いた正規化により補償する。好ましくは交通信号灯に用いるような高輝度発光ダイオード（１２２，１３２，４０２，４０４）を配列の励起に用い、好ましくはこの励起は固体内部反射均質化器（１３０）を介して配列に導入する。中程度の被写界深度収集及び撮像光学系が、０．３０〜０．６０の範囲、好ましくは０．４〜０．５５の範囲のＮＡでもって実質的な集光を可能にする。得られる比較的大きな被写界深度は一部の好都合なケースでは、撮像対象スポットを越えて進行しがちで或いはノイズ蛍光を生成しかねない光を吸収することで補償され、例えば基板（３０２）、好ましくは配列が横たわる極薄基板とより肉厚のガラス又は他の剛性支持体（３０６）との間に介挿した不透明金属酸化物被覆（３０４）により吸収を生ずる。臨床目的に合わせ、配列は蛋白質に適した１０００スポット未満からなり、一例では、５００スポット未満の配列とする。比較的大きなスポット寸法を用い、例えば少なくとも８０又は１００ミクロン台の直径、或いは好ましくはそれを上回り、１５０又は３００ミクロンのスポットを用いる。ソリッドステート検出器上の少なくとも５０画素に対するこの種のスポットの解像度によって適切なビニングと高精度成果に通ずる他の操作が可能になる。癌診断等の分析及び診断の新規方法は、疾患、例えば卵巣癌に関連するマーカ群の検出に読み取り器を用いる。